张大可，男，遗传学博士

北京航空航天大学，医学科学与工程学院，副教授，中国科学院青年创新促进会会员。

工作经历:

2020年入职北京航空航天大学北京生物医学工程高精尖中心；

2018年获中国遗传学会遗传咨询分会高级遗传咨询师认证；

2016年入选中国科学院青年创新促进会；

2014年12月公派留学美国贝勒医学院分子与人类遗传系；

2009年作为助理研究员入职中科院精准基因组医学重点实验室从事基因组学研究；

2009年中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）获遗传学博士学位；

学术兼职：

BMC Medicine, Associate Editor（Oncology Section,2023年3月至今）;

Cell Press合作刊 The Innovation杂志 组稿编辑 （2020年5月至今）；

Cell Press旗下Heliyon杂志Associate Editor （Genetics Section，2022年至今）；

北航生物医学工程高精尖期刊 Medicine in Novel Technology and Devices 杂志 编委；

中国抗癌学会肿瘤测序与大数据分析专家委员会委员。

主要研究方向:

疾病发生发展中的受累细胞群体基因组学特征与疾病精准诊疗。共发表论文40篇，其中第一作者或通讯作者SCI论文25篇。主持及参加国自然、科技部科技部国家“十三五”精准医学重点研发计划、863计划、973计划、国家科技支撑计划、中科院重点部署项目等十余项。

近5年主要研究成果(#共同一作；$共同通讯):

HBV感染后肝癌的转化基因组学研究

1. 焦亡相关基因的基因体甲基化水平改变可作为肝癌液体活检方案中的标志物。Zhang H, Dong P, Fan H, Liang H, Zhang K, Zhao Y, Guo S, Schrodi SJ, Fan Y, Zhang D. Gene body hypomethylation of pyroptosis-related genes NLRP7, NLRP2, and NLRP3 facilitate non-invasive surveillance of hepatocellular carcinoma. Functional & Integrative Genomics. 2023 Jun;23(2):198.

2. 肝脏穿刺组织中的HBV-宿主整合谱提示抗病毒治疗可以改变肝脏内病毒整合事件的积累，降低病毒整合对于肝癌发生的风险。Zhang M, Zhang H, Cheng X, Wang X, Xu H, Gao X, Wu R, Zhang D, Xia Y, Niu J. Liver biopsy of chronic hepatitis B patients indicates HBV integration profile may complicate the endpoint and effect of entecavir treatment. Antiviral Research. 2022 Aug 1;204:105363.

3  HBV-肝细胞互作中的基因组DNA甲基化在病理改变和肿瘤发生中的作用。Zhang D$, Guo S, Schrodi SJ$. Mechanisms of DNA Methylation in Virus-Host Interaction in Hepatitis B Infection: Pathogenesis and Oncogenetic Properties. International Journal of Molecular Sciences. 2021; 22(18)

4. HBV-人基因组DNA整合的高通量测序方案以及病毒整合相关功能改变。Zhang D$, Zhang K, Protzer U, Zeng C. HBV Integration Induces Complex Interactions between Host and Viral Genomic Functions at the Insertion Site. J Clin Transl Hepatol 2021, 9(3): 399-408.

5.    在cfDNA全基因组甲基化分析中，确定特定基因组区域在低重数覆盖度下对肝癌患者的预测性能可以达到全基因组较高测序通量时的同等水平，可以有效降低cfDNA测序量的需求，使基于cfDNA甲基化的肝癌筛查技术有了更广临床应用的可能以及在为相关研究中以较低成本进行cfDNA甲基化分析提供了解决思路。Zhang H, Dong P, Guo S, Tao C, Chen W, Zhao W, Wang J, Cheung R, Villanueva A, Fan J, Ding H, Schrodi S. J, Zhang D$ and Zeng C$. Hypomethylation in HBV integration regions aids non-invasive surveillance to hepatocellular carcinoma by low-pass genome-wide bisulfite sequencing. BMC Med.2020;18(1):200.

6.    基于外周血病毒-宿主整合片断捕获技术的HBV感染后肝癌预警方案，也可成为靶向病毒整合蛋白免疫治疗方案的辅助评价工具。Chen W*, Zhang K*, Dong P*, Fanning G, Tao C, Zhang H, Guo S, Wang Z, Hong Y, Yang X, Lai S, Ding H, Zhao H, Zeng C$, Protzer U$, Zhang D$. Noninvasive chimeric DNA profiling identifies tumor-originated HBV integrants contributing to viral antigen expression in liver cancer. Hepatol Int.2020;14(3):326-337.

肿瘤表观遗传学与生物标志物

1. 不同级别脑膜瘤单细胞转录组揭示免疫微环境中关键的免疫细胞-肿瘤细胞互作。 Fan H, Song L, Fan J, Ma J, Li X, Zhang J, Hu J, Wu Z, Zhang D$, Wang L$. Decoding meningioma heterogeneity and neoplastic cell-macrophage interaction through single-cell transcriptome profiling across pathological grades. J Transl Med. 2023 Oct 25;21(1):751.

2. 泛癌前揭示不同组织从癌前阶段向肿瘤阶段演化中DNA甲基化特征性改变的组织特异性。Zhang F, Zhang X, Zhang H, Lin D, Fan H, Guo S, An F, Zhao Y, Li J$, Schrodi SJ$, Zhang D$. Pan-precancer and cancer DNA methylation profiles revealed significant tissue specificity of interrupted biological processes in tumorigenesis. Epigenetics. 2023 Dec 31;18(1):2231222.

3. 高低级别腺瘤全基因组甲基化谱揭示肿瘤基因组中特定位点的甲基化水平改变可以追溯至良性腺瘤的早期阶段，可作为结直肠癌早诊的标志物。Fan J, Li J, Guo S, Tao C, Zhang H, Wang W, Zhang Y, Zhang D$, Ding S$ and Zeng C$.Genome-wide DNA methylation profiles of low- and high-grade adenoma reveals potential biomarkers for early detection of colorectal carcinoma.Clin Epigenetics.2020;12(1):56.

人类疾病的转化基因组学研究

1. 肥厚型心肌病患者的DNA甲基化谱特征改变揭示心肌内的电生理和免疫失调是最关键的病理改变。Li X, Fan H, Song X, Song B, Liu W, Dong R, Zhang H, Guo S, Liang H, Schrodi SJ, Fu X, Kaushal S, Ren Y$, Zhang D$. DNA methylome and transcriptome profiling reveal key electrophysiology and immune dysregulation in hypertrophic cardiomyopathy. Epigenetics. 2023;18(1):2195307.

2.  单细胞组学技术的研究与应用. Wen L, Li G, Huang T, Geng W, Pei H, Yang J, Zhu M, Zhang P, Hou R, Tian G, Su W, Chen J, Zhang D, Zhu P, Zhang W, Zhang X, Zhang N, Zhao Y, Cao X, Peng G, Ren X, Jiang N, Tian C, Chen Z-J. Single-cell technologies: From research to application. The Innovation 2022, 3(6): 100342.

3. 健康个体多组织后合子突变深度分析发现胚胎发育早期缺氧可在个体基因组中留下特征标记。Hong Y*, Zhang D*, Zhou X*, Chen A*, Abliz A*, Bai J, Wang L, Hu Q, Gong K, Guan X, Liu M, Zheng X, Lai S, Qu H, Zhao F, Hao S, Wu Z, Cai H, Hu S, Ma Y, Zhang J, Ke Y, Wang Q-f, Chen W$, Zeng C$. Common Postzygotic Mutational Signatures in Healthy Adult Tissues Related to Embryonic Hypoxia. Genomics, Proteomics & Bioinformatics. 2021

4. 在高度近视人群中分析全部已知KEGG通路中的微效单核苷酸多态位点对疾病发生的贡献，在3个独立近视人群队列中检验多态显著富集的通路，为合作单位提出近视发生中“巩膜缺氧微环境是诱导巩膜成纤维细胞向肌成纤维细胞分化，导致细胞外基质重塑”的分子机制提供了遗传学证据。Zhao F*, Zhang D*, Zhou Q, Zhao F, He M, Yang Z, Su Y, Zhai Y, Yan J, Zhang G, Xue A, Tang J, Han X, Shi Y, Zhu Y, Liu T, Zhuang W, Huang L, Hong Y, Wu D, Li Y, Lu Q, Chen W, Jiao S, Wang Q, Srinivasalu N, Wen Y, Zeng C, Qu J$ and Zhou X$. Scleral HIF-1alpha is a prominent regulatory candidate for genetic and environmental interactions in human myopia pathogenesis. EBioMedicine. 2020;57.102878.